Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Shisal1Q0VBP7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Shisal1Q0VBP7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Shisal1Q0VBP7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Shisal1Q0VBP7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms