Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SMAGPQ0VAQ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMAGPQ0VAQ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMAGPQ0VAQ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms