Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TrioQ0KL02 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TrioQ0KL02 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TrioQ0KL02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TrioQ0KL02 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms