Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gcnt1Q09324 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gcnt1Q09324 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gcnt1Q09324 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Gcnt1Q09324 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gcnt1Q09324 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms