Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pate4Q09098 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pate4Q09098 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pate4Q09098 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pate4Q09098 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms