Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 TUB1YML085C 1344 nt7.29□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 SPE4YLR146C 903 nt7.29□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 MBF1YOR298C-A 456 nt7.29□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 NFS1YCL017C 1494 nt7.29□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 PLB3YOL011W 2061 nt7.28□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 PET10YKR046C 852 nt7.28□□□□□ -1.24
CLP1Q08685 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.27□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.27□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 DAL80YKR034W 810 nt7.27□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 YPQ2YDR352W 954 nt7.26□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 SRY1YKL218C 981 nt7.26□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 PUS4YNL292W 1212 nt7.26□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 ZIM17YNL310C 525 nt7.25□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 YJL213WYJL213W 996 nt7.24□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 PMT1YDL095W 2454 nt7.23□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 FET4YMR319C 1659 nt7.23□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 OPI1YHL020C 1215 nt7.23□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 PEX28YHR150W 1740 nt7.22□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 YPL264CYPL264C 1062 nt7.22□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 GYP8YFL027C 1494 nt7.22□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 SGF73YGL066W 1974 nt7.22□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 AVL9YLR114C 2295 nt7.21□□□□□ -1.25
CLP1Q08685 CCW12YLR110C 402 nt7.21□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 YLR162WYLR162W 357 nt7.21□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 ERV25YML012W 636 nt7.21□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 RBS1YDL189W 1374 nt7.2□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 CKB1YGL019W 837 nt7.2□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 CAR2YLR438W 1275 nt7.2□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 HXT9YJL219W 1704 nt7.2□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 CYS4YGR155W 1524 nt7.2□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 TRR1YDR353W 960 nt7.19□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 MPE1YKL059C 1326 nt7.19□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 CIT2YCR005C 1383 nt7.19□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 HMS2YJR147W 1077 nt7.18□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 SML1YML058W 315 nt7.18□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 RCF2YNR018W 675 nt7.18□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 snR30snR30 606 nt7.18□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 TPO1YLL028W 1761 nt7.18□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 PRB1YEL060C 1908 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 BDS1YOL164W 1941 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 YDR215CYDR215C 414 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 ERP2YAL007C 648 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 GET4YOR164C 939 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 YOR300WYOR300W 309 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 ERG12YMR208W 1332 nt7.17□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 FRE5YOR384W 2085 nt7.16□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 ECM30YLR436C 3825 nt7.16□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 YBL070CYBL070C 321 nt7.16□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 BIO3YNR058W 1443 nt7.16□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 POB3YML069W 1659 nt7.16□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 LDB7YBL006C 543 nt7.15□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 YPR130CYPR130C 408 nt7.15□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 DPM1YPR183W 804 nt7.15□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 ERG24YNL280C 1317 nt7.15□□□□□ -1.26
CLP1Q08685 RSC9YML127W 1746 nt7.15□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 PET117YER058W 324 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 PDA1YER178W 1263 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 MPH3YJR160C 1809 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 PDC5YLR134W 1692 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 LEO1YOR123C 1395 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 ERG10YPL028W 1197 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 YAH1YPL252C 519 nt7.14□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 SGV1YPR161C 1974 nt7.13□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 DCR2YLR361C 1737 nt7.13□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 GPD1YDL022W 1176 nt7.13□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 YPR076WYPR076W 375 nt7.13□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 NAF1YNL124W 1479 nt7.12□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 POR2YIL114C 846 nt7.12□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 RTC2YBR147W 891 nt7.12□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 CIA1YDR267C 993 nt7.11□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 SNF7YLR025W 723 nt7.11□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 MRPL35YDR322W 1104 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 YDR327WYDR327W 327 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 LIA1YJR070C 978 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 HOC1YJR075W 1191 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 FCY22YER060W-A 1593 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 RUP1YOR138C 2016 nt7.1□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 YOR389WYOR389W 1875 nt7.09□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 YPL136WYPL136W 369 nt7.09□□□□□ -1.27
CLP1Q08685 NMT1YLR195C 1368 nt7.08□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 SSC1YJR045C 1965 nt7.08□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 YHC3YJL059W 1227 nt7.08□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 YJL163CYJL163C 1668 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 SNA3YJL151C 402 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 YLR030WYLR030W 792 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 VPS65YLR322W 315 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 YOL046CYOL046C 675 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 YCL049CYCL049C 939 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 HXT15YDL245C 1704 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 HXT16YJR158W 1704 nt7.07□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 MKK1YOR231W 1527 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 SUN4YNL066W 1263 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 RTC4YNL254C 1206 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 SLX5YDL013W 1860 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 PLB2YMR006C 2121 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 PPS1YBR276C 2424 nt7.06□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 HTZ1YOL012C 405 nt7.05□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 MPA43YNL249C 1629 nt7.05□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 VMA2YBR127C 1554 nt7.04□□□□□ -1.28
CLP1Q08685 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.04□□□□□ -1.28
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