Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kcnma1Q08460 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kcnma1Q08460 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kcnma1Q08460 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnma1Q08460 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnma1Q08460 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms