Protein–RNA interactions for Protein: Q08412

CUE5, Ubiquitin-binding protein CUE5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE5Q08412 CMK2YOL016C 1344 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 AFG2YLR397C 2343 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 YMR074CYMR074C 438 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 ADH6YMR318C 1083 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 ENB1YOL158C 1821 nt7.28□□□□□ -1.24
CUE5Q08412 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 PET117YER058W 324 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 HEL1YKR017C 1656 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 PGI1YBR196C 1665 nt7.27□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 AQR1YNL065W 1761 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 PAM17YKR065C 594 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 BNA3YJL060W 1335 nt7.26□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 RBS1YDL189W 1374 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 LOT6YLR011W 576 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 YML122CYML122C 381 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 YPL041CYPL041C 624 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 SDH8YBR269C 417 nt7.25□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 ERG27YLR100W 1044 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 ATP23YNR020C 813 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 GFA1YKL104C 2154 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 YIL108WYIL108W 2091 nt7.23□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 CIT2YCR005C 1383 nt7.22□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 SNF4YGL115W 969 nt7.22□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.22□□□□□ -1.25
CUE5Q08412 ATO2YNR002C 849 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 RPL43AYPR043W 279 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 DPM1YPR183W 804 nt7.21□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YCR041WYCR041W 333 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 EDC2YER035W 438 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 DMC1YER179W 1005 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 SUN4YNL066W 1263 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 ASN2YGR124W 1719 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 EHD3YDR036C 1503 nt7.2□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 PIH1YHR034C 1035 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 RFS1YBR052C 633 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YOS9YDR057W 1629 nt7.19□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 PHO85YPL031C 918 nt7.18□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 NFS1YCL017C 1494 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 UME1YPL139C 1383 nt7.17□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 AIM2YAL049C 741 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 RTC4YNL254C 1206 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YOR012WYOR012W 414 nt7.16□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YPQ2YDR352W 954 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 THR1YHR025W 1074 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YLR112WYLR112W 420 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YML079WYML079W 606 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 YNL040WYNL040W 1371 nt7.15□□□□□ -1.26
CUE5Q08412 CTA1YDR256C 1548 nt7.15□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 RGT2YDL138W 2292 nt7.15□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 NMD5YJR132W 3147 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YCR049CYCR049C 447 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 TRR2YHR106W 1029 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 MHP1YJL042W 4197 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 TUB1YML085C 1344 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 DML1YMR211W 1428 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YPL067CYPL067C 597 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YPR127WYPR127W 1038 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 ATG22YCL038C 1587 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 IRC5YFR038W 2562 nt7.14□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YBL111CYBL111C 2004 nt7.13□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 CIT3YPR001W 1461 nt7.13□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 MPE1YKL059C 1326 nt7.13□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 HPT1YDR399W 666 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 CYS3YAL012W 1185 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YPQ1YOL092W 927 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YPR130CYPR130C 408 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 HXT13YEL069C 1695 nt7.12□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 PTH2YBL057C 627 nt7.11□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 MBF1YOR298C-A 456 nt7.11□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 GPA1YHR005C 1419 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 DLD1YDL174C 1764 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 PLB2YMR006C 2121 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 SHO1YER118C 1104 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 PDA1YER178W 1263 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 PRS4YBL068W 981 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 SNT309YPR101W 528 nt7.1□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 TDP1YBR223C 1635 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 YCR061WYCR061W 1896 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 MIX17YMR002W 471 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 GET4YOR164C 939 nt7.09□□□□□ -1.27
CUE5Q08412 CEM1YER061C 1329 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 NUP84YDL116W 2181 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 MSB3YNL293W 1902 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 HGH1YGR187C 1185 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YOR268CYOR268C 399 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 CST26YBR042C 1194 nt7.08□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 PAC10YGR078C 600 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 MTR3YGR158C 753 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 IDP3YNL009W 1263 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 snR30snR30 606 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YBR226CYBR226C 411 nt7.07□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 AMN1YBR158W 1650 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 MSG5YNL053W 1470 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 BRN1YBL097W 2265 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 CIA1YDR267C 993 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 PRE5YMR314W 705 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 FCP1YMR277W 2199 nt7.06□□□□□ -1.28
CUE5Q08412 CDC13YDL220C 2775 nt7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.7 ms