Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNB2Q08289 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CACNB2Q08289 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNB2Q08289 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNB2Q08289 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.2 ms