Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cdx4Q07424 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdx4Q07424 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdx4Q07424 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdx4Q07424 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms