Protein–RNA interactions for Protein: Q06333

CNL1, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit CNL1, yeastyeast

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CNL1Q06333 MRPL28YDR462W 444 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 NIF3YGL221C 867 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 PMU1YKL128C 888 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 YPR127WYPR127W 1038 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 HXT15YDL245C 1704 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 HXT16YJR158W 1704 nt5.59□□□□□ -1.51
CNL1Q06333 RAP1YNL216W 2484 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 CEM1YER061C 1329 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 MOB1YIL106W 945 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YBL070CYBL070C 321 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YNR014WYNR014W 639 nt5.58□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 SWM1YDR260C 513 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 NCA3YJL116C 1014 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YUR1YJL139C 1287 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 ADH3YMR083W 1128 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 PHO85YPL031C 918 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 VHT1YGR065C 1782 nt5.57□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 KTR5YNL029C 1569 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 GET2YER083C 858 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 CAK1YFL029C 1107 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 MIX17YMR002W 471 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 CDC7YDL017W 1524 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 IRC5YFR038W 2562 nt5.56□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 PHB2YGR231C 933 nt5.55□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 ATG22YCL038C 1587 nt5.55□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 JHD1YER051W 1479 nt5.54□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 PPH22YDL188C 1134 nt5.54□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YHC3YJL059W 1227 nt5.54□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YJL144WYJL144W 315 nt5.54□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 FZF1YGL254W 900 nt5.53□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YLR280CYLR280C 351 nt5.53□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 AIM33YML087C 939 nt5.53□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 RPL5YPL131W 894 nt5.53□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 HIS7YBR248C 1659 nt5.53□□□□□ -1.52
CNL1Q06333 YML034C-AYML034C-A 399 nt5.52□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 CUE4YML101C 354 nt5.52□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YMR166CYMR166C 1107 nt5.52□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 DLD1YDL174C 1764 nt5.52□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 RDR1YOR380W 1641 nt5.52□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 BDS1YOL164W 1941 nt5.51□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 SRP102YKL154W 735 nt5.51□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YEL020CYEL020C 1683 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 HXT17YNR072W 1695 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 RSA4YCR072C 1548 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 INP54YOL065C 1155 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YOL099CYOL099C 492 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YOR300WYOR300W 309 nt5.5□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 STE3YKL178C 1413 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 SAC6YDR129C 1929 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 SUF3tG(CCC)D 72 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YMR074CYMR074C 438 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 RPL43AYPR043W 279 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 SGV1YPR161C 1974 nt5.49□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YPL247CYPL247C 1572 nt5.48□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 THR1YHR025W 1074 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 YIL077CYIL077C 963 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 RRT14YIL127C 621 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 GCN3YKR026C 918 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 GEF1YJR040W 2340 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 CSC1YLR241W 2349 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 PGI1YBR196C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
CNL1Q06333 CYC3YAL039C 810 nt5.46□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 ADH5YBR145W 1056 nt5.46□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YNL295WYNL295W 1575 nt5.46□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 TUF1YOR187W 1314 nt5.46□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 HDA1YNL021W 2121 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 RGD1YBR260C 2001 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 CDD1YLR245C 429 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YPT10YBR264C 600 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 MSG5YNL053W 1470 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YFR006WYFR006W 1608 nt5.45□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 PEX31YGR004W 1389 nt5.44□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 PAC2YER007W 1557 nt5.44□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 DYS1YHR068W 1164 nt5.44□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YMR206WYMR206W 942 nt5.44□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 SLA2YNL243W 2907 nt5.44□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 ERO1YML130C 1692 nt5.43□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 RMD9YGL107C 1941 nt5.43□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 HIS1YER055C 894 nt5.43□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 QNS1YHR074W 2145 nt5.43□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 LDB19YOR322C 2457 nt5.43□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 BZZ1YHR114W 1902 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 RGD2YFL047W 2145 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 PPM1YDR435C 987 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YKR032WYKR032W 315 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 ATP4YPL078C 735 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 SES1YDR023W 1389 nt5.42□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 SKN1YGR143W 2316 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YDR387CYDR387C 1668 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 CIS3YJL158C 684 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 YJR107WYJR107W 987 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 ATF1YOR377W 1578 nt5.41□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 IMA5YJL216C 1746 nt5.4□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.4□□□□□ -1.54
CNL1Q06333 LSP1YPL004C 1026 nt5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.7 ms