Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDSPL2Q05D32 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CTDSPL2Q05D32 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTDSPL2Q05D32 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTDSPL2Q05D32 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTDSPL2Q05D32 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms