Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtprgQ05909 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
PtprgQ05909 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PtprgQ05909 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PtprgQ05909 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PtprgQ05909 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PtprgQ05909 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PtprgQ05909 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms