Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox13Q04891 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox13Q04891 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sox13Q04891 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sox13Q04891 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms