Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top1Q04750 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top1Q04750 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Top1Q04750 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top1Q04750 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top1Q04750 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top1Q04750 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1Q04750 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Top1Q04750 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1Q04750 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1Q04750 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Top1Q04750 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Top1Q04750 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms