Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EMX2Q04743 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMX2Q04743 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EMX2Q04743 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMX2Q04743 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX2Q04743 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX2Q04743 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMX2Q04743 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMX2Q04743 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms