Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBXN1Q04323 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBXN1Q04323 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBXN1Q04323 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UBXN1Q04323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBXN1Q04323 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms