Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnd1Q03719 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnd1Q03719 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Kcnd1Q03719 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnd1Q03719 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnd1Q03719 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnd1Q03719 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.3 ms