Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC44.26■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.68
ERCC6Q03468 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.22■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC44.2■■■■■ 4.67
ERCC6Q03468 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC44.15■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
ERCC6Q03468 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.11■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
ERCC6Q03468 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
ERCC6Q03468 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC44■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
ERCC6Q03468 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
ERCC6Q03468 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
ERCC6Q03468 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms