Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC25A11Q02978 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC25A11Q02978 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC25A11Q02978 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC25A11Q02978 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC25A11Q02978 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms