Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUCB1Q02818 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NUCB1Q02818 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NUCB1Q02818 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NUCB1Q02818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NUCB1Q02818 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms