Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnnb1Q02248 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnnb1Q02248 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnnb1Q02248 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnnb1Q02248 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnnb1Q02248 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ctnnb1Q02248 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms