Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BNC1Q01954 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BNC1Q01954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BNC1Q01954 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BNC1Q01954 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms