Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CLTCQ00610 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CLTCQ00610 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
CLTCQ00610 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.53
CLTCQ00610 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
CLTCQ00610 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms