Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
F8a1Q00558 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
F8a1Q00558 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
F8a1Q00558 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F8a1Q00558 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
F8a1Q00558 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms