Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNB1P98172 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNB1P98172 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFNB1P98172 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms