Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ElocP83940 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ElocP83940 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ElocP83940 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ElocP83940 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ElocP83940 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ElocP83940 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ElocP83940 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ElocP83940 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ElocP83940 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ElocP83940 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ElocP83940 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ElocP83940 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ElocP83940 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ElocP83940 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ElocP83940 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ElocP83940 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ElocP83940 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ElocP83940 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ElocP83940 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ElocP83940 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElocP83940 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElocP83940 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElocP83940 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ElocP83940 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ElocP83940 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ElocP83940 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ElocP83940 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ElocP83940 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ElocP83940 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElocP83940 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElocP83940 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElocP83940 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ElocP83940 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ElocP83940 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ElocP83940 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ElocP83940 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ElocP83940 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ElocP83940 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ElocP83940 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ElocP83940 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ElocP83940 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ElocP83940 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ElocP83940 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ElocP83940 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ElocP83940 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ElocP83940 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ElocP83940 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ElocP83940 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ElocP83940 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ElocP83940 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ElocP83940 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ElocP83940 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ElocP83940 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ElocP83940 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ElocP83940 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ElocP83940 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ElocP83940 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ElocP83940 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ElocP83940 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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