Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cbx1P83917 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cbx1P83917 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cbx1P83917 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cbx1P83917 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms