Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMF1P82094 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMF1P82094 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TMF1P82094 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMF1P82094 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMF1P82094 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMF1P82094 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TMF1P82094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMF1P82094 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TMF1P82094 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TMF1P82094 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TMF1P82094 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TMF1P82094 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TMF1P82094 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TMF1P82094 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMF1P82094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TMF1P82094 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TMF1P82094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TMF1P82094 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMF1P82094 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMF1P82094 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMF1P82094 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TMF1P82094 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMF1P82094 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TMF1P82094 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMF1P82094 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TMF1P82094 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMF1P82094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMF1P82094 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMF1P82094 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMF1P82094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TMF1P82094 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TMF1P82094 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMF1P82094 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMF1P82094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TMF1P82094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TMF1P82094 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMF1P82094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TMF1P82094 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TMF1P82094 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TMF1P82094 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMF1P82094 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMF1P82094 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TMF1P82094 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TMF1P82094 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TMF1P82094 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TMF1P82094 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TMF1P82094 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TMF1P82094 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TMF1P82094 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TMF1P82094 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TMF1P82094 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TMF1P82094 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TMF1P82094 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TMF1P82094 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMF1P82094 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TMF1P82094 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMF1P82094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMF1P82094 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMF1P82094 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMF1P82094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TMF1P82094 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
TMF1P82094 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TMF1P82094 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
TMF1P82094 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
TMF1P82094 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
TMF1P82094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TMF1P82094 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TMF1P82094 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
TMF1P82094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
TMF1P82094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TMF1P82094 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
TMF1P82094 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TMF1P82094 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TMF1P82094 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TMF1P82094 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TMF1P82094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMF1P82094 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMF1P82094 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMF1P82094 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TMF1P82094 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TMF1P82094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TMF1P82094 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms