Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELF3P78545 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF3P78545 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELF3P78545 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF3P78545 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELF3P78545 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELF3P78545 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF3P78545 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF3P78545 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF3P78545 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ELF3P78545 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF3P78545 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF3P78545 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF3P78545 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF3P78545 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ELF3P78545 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF3P78545 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF3P78545 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF3P78545 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ELF3P78545 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ELF3P78545 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ELF3P78545 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELF3P78545 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELF3P78545 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELF3P78545 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ELF3P78545 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELF3P78545 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELF3P78545 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ELF3P78545 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ELF3P78545 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ELF3P78545 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELF3P78545 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELF3P78545 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELF3P78545 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ELF3P78545 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELF3P78545 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELF3P78545 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ELF3P78545 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ELF3P78545 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ELF3P78545 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ELF3P78545 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELF3P78545 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELF3P78545 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ELF3P78545 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ELF3P78545 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ELF3P78545 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ELF3P78545 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELF3P78545 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ELF3P78545 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELF3P78545 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ELF3P78545 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ELF3P78545 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ELF3P78545 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ELF3P78545 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ELF3P78545 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ELF3P78545 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ELF3P78545 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ELF3P78545 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270 ms