Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPHP78330 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPHP78330 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPHP78330 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSPHP78330 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPHP78330 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPHP78330 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPHP78330 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPHP78330 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSPHP78330 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPHP78330 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPHP78330 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSPHP78330 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSPHP78330 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PSPHP78330 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPHP78330 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPHP78330 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPHP78330 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSPHP78330 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPHP78330 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPHP78330 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPHP78330 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSPHP78330 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPHP78330 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPHP78330 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPHP78330 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSPHP78330 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPHP78330 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPHP78330 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPHP78330 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPHP78330 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPHP78330 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPHP78330 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPHP78330 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPHP78330 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPHP78330 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPHP78330 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPHP78330 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPHP78330 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPHP78330 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPHP78330 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPHP78330 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPHP78330 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPHP78330 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPHP78330 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPHP78330 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPHP78330 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPHP78330 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPHP78330 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPHP78330 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPHP78330 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPHP78330 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPHP78330 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSPHP78330 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSPHP78330 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms