Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HBBP68871 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBBP68871 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBBP68871 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HBBP68871 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HBBP68871 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HBBP68871 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HBBP68871 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HBBP68871 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HBBP68871 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HBBP68871 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HBBP68871 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HBBP68871 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HBBP68871 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HBBP68871 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HBBP68871 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HBBP68871 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HBBP68871 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HBBP68871 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HBBP68871 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HBBP68871 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HBBP68871 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HBBP68871 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HBBP68871 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HBBP68871 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HBBP68871 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HBBP68871 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HBBP68871 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HBBP68871 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HBBP68871 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HBBP68871 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HBBP68871 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HBBP68871 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HBBP68871 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HBBP68871 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HBBP68871 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HBBP68871 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HBBP68871 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HBBP68871 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HBBP68871 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HBBP68871 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HBBP68871 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HBBP68871 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HBBP68871 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HBBP68871 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HBBP68871 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HBBP68871 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HBBP68871 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HBBP68871 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HBBP68871 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HBBP68871 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HBBP68871 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HBBP68871 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HBBP68871 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HBBP68871 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms