Protein–RNA interactions for Protein: P68500

Cntn5, Contactin-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn5P68500 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cntn5P68500 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cntn5P68500 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cntn5P68500 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cntn5P68500 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cntn5P68500 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms