Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubb4bP68372 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubb4bP68372 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubb4bP68372 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubb4bP68372 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubb4bP68372 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms