Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TPM4P67936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TPM4P67936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM4P67936 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM4P67936 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM4P67936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TPM4P67936 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM4P67936 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM4P67936 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM4P67936 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TPM4P67936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM4P67936 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM4P67936 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM4P67936 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TPM4P67936 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM4P67936 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM4P67936 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM4P67936 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TPM4P67936 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM4P67936 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM4P67936 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM4P67936 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TPM4P67936 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TPM4P67936 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM4P67936 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM4P67936 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM4P67936 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM4P67936 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TPM4P67936 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM4P67936 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM4P67936 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TPM4P67936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM4P67936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM4P67936 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM4P67936 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TPM4P67936 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TPM4P67936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM4P67936 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM4P67936 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM4P67936 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM4P67936 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TPM4P67936 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM4P67936 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM4P67936 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM4P67936 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM4P67936 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TPM4P67936 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM4P67936 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM4P67936 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM4P67936 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TPM4P67936 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPM4P67936 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TPM4P67936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM4P67936 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TPM4P67936 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TPM4P67936 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM4P67936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM4P67936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TPM4P67936 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM4P67936 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TPM4P67936 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TPM4P67936 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TPM4P67936 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TPM4P67936 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TPM4P67936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM4P67936 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TPM4P67936 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TPM4P67936 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms