Protein–RNA interactions for Protein: P63163

Snrpn, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpnP63163 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SnrpnP63163 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SnrpnP63163 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SnrpnP63163 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SnrpnP63163 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpnP63163 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SnrpnP63163 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpnP63163 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SnrpnP63163 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpnP63163 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpnP63163 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SnrpnP63163 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms