Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNRPNP63162 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRPNP63162 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNRPNP63162 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNRPNP63162 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNRPNP63162 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms