Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmgb1P63158 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmgb1P63158 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmgb1P63158 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmgb1P63158 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmgb1P63158 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms