Protein–RNA interactions for Protein: P63058

Thra, Thyroid hormone receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThraP63058 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ThraP63058 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ThraP63058 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ThraP63058 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ThraP63058 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ThraP63058 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ThraP63058 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ThraP63058 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThraP63058 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ThraP63058 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ThraP63058 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ThraP63058 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ThraP63058 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ThraP63058 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ThraP63058 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ThraP63058 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ThraP63058 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ThraP63058 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ThraP63058 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ThraP63058 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ThraP63058 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ThraP63058 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ThraP63058 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ThraP63058 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ThraP63058 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ThraP63058 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ThraP63058 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ThraP63058 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ThraP63058 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ThraP63058 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ThraP63058 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ThraP63058 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ThraP63058 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ThraP63058 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ThraP63058 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ThraP63058 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ThraP63058 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ThraP63058 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ThraP63058 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThraP63058 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ThraP63058 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThraP63058 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThraP63058 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ThraP63058 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ThraP63058 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ThraP63058 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms