Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx1P63013 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx1P63013 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx1P63013 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrx1P63013 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrx1P63013 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prrx1P63013 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prrx1P63013 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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