Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl30P62889 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rpl30P62889 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl30P62889 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl30P62889 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms