Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rps25P62852 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps25P62852 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rps25P62852 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps25P62852 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps25P62852 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps25P62852 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rps25P62852 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps25P62852 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps25P62852 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rps25P62852 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rps25P62852 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps25P62852 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rps25P62852 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps25P62852 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms