Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS25P62851 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS25P62851 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS25P62851 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS25P62851 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS25P62851 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS25P62851 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS25P62851 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS25P62851 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS25P62851 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS25P62851 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS25P62851 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS25P62851 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS25P62851 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS25P62851 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS25P62851 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS25P62851 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS25P62851 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS25P62851 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS25P62851 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS25P62851 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS25P62851 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS25P62851 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS25P62851 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS25P62851 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS25P62851 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS25P62851 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS25P62851 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS25P62851 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS25P62851 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS25P62851 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS25P62851 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS25P62851 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS25P62851 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS25P62851 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS25P62851 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS25P62851 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPS25P62851 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS25P62851 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS25P62851 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS25P62851 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS25P62851 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPS25P62851 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS25P62851 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS25P62851 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPS25P62851 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS25P62851 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS25P62851 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS25P62851 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS25P62851 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS25P62851 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS25P62851 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS25P62851 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS25P62851 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS25P62851 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS25P62851 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS25P62851 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS25P62851 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS25P62851 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS25P62851 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS25P62851 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS25P62851 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS25P62851 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS25P62851 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS25P62851 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS25P62851 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms