Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl23P62830 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl23P62830 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl23P62830 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms