Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL23P62829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23P62829 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23P62829 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23P62829 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL23P62829 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL23P62829 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL23P62829 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL23P62829 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL23P62829 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL23P62829 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL23P62829 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL23P62829 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL23P62829 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL23P62829 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL23P62829 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL23P62829 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL23P62829 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL23P62829 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL23P62829 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL23P62829 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL23P62829 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL23P62829 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL23P62829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL23P62829 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL23P62829 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL23P62829 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL23P62829 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23P62829 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23P62829 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23P62829 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23P62829 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL23P62829 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23P62829 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23P62829 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL23P62829 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23P62829 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23P62829 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL23P62829 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms