Protein–RNA interactions for Protein: P62753

RPS6, 40S ribosomal protein S6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6P62753 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RPS6P62753 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPS6P62753 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6P62753 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6P62753 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6P62753 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RPS6P62753 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RPS6P62753 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6P62753 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RPS6P62753 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6P62753 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6P62753 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPS6P62753 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6P62753 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RPS6P62753 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6P62753 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6P62753 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6P62753 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RPS6P62753 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6P62753 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6P62753 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6P62753 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6P62753 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RPS6P62753 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6P62753 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6P62753 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RPS6P62753 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6P62753 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPS6P62753 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6P62753 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6P62753 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6P62753 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6P62753 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6P62753 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPS6P62753 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6P62753 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6P62753 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RPS6P62753 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RPS6P62753 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6P62753 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6P62753 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6P62753 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6P62753 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPS6P62753 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RPS6P62753 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RPS6P62753 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6P62753 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPS6P62753 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RPS6P62753 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RPS6P62753 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6P62753 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6P62753 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6P62753 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPS6P62753 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6P62753 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6P62753 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6P62753 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6P62753 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RPS6P62753 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6P62753 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6P62753 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6P62753 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6P62753 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPS6P62753 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6P62753 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RPS6P62753 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RPS6P62753 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms