Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPD3P62318 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPD3P62318 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPD3P62318 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNRPD3P62318 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNRPD3P62318 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNRPD3P62318 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SNRPD3P62318 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPD3P62318 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms