Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SnrpfP62307 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SnrpfP62307 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SnrpfP62307 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SnrpfP62307 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SnrpfP62307 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms