Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNRPEP62304 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNRPEP62304 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNRPEP62304 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNRPEP62304 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms