Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps11P62281 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps11P62281 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps11P62281 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps11P62281 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rps11P62281 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rps11P62281 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps11P62281 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rps11P62281 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps11P62281 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rps11P62281 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rps11P62281 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms